MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis A2497 chromosome

Total Repeats: 23059

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017437	AGG	2	6	18	23	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385269642
2	NC_017437	GGAT	2	8	57	64	25 %	25 %	50 %	0 %	385269642
3	NC_017437	GAA	2	6	87	92	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385269642
4	NC_017437	GTTC	2	8	109	116	0 %	50 %	25 %	25 %	385269642
5	NC_017437	GTA	2	6	131	136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385269642
6	NC_017437	AGT	2	6	162	167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385269642
7	NC_017437	GA	3	6	206	211	50 %	0 %	50 %	0 %	385269642
8	NC_017437	GCGT	2	8	294	301	0 %	25 %	50 %	25 %	385269642
9	NC_017437	AAG	2	6	318	323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385269642
10	NC_017437	CAA	2	6	332	337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385269642
11	NC_017437	AGT	2	6	358	363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385269642
12	NC_017437	GTG	2	6	374	379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385269642
13	NC_017437	CAG	2	6	410	415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385269642
14	NC_017437	AGTG	2	8	541	548	25 %	25 %	50 %	0 %	385269642
15	NC_017437	TGGC	2	8	575	582	0 %	25 %	50 %	25 %	385269642
16	NC_017437	GCC	2	6	598	603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385269642
17	NC_017437	TGC	2	6	657	662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385269642
18	NC_017437	ATT	2	6	669	674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385269642
19	NC_017437	CGA	2	6	691	696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385269642
20	NC_017437	TC	3	6	819	824	0 %	50 %	0 %	50 %	385269642
21	NC_017437	TAT	2	6	833	838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385269642
22	NC_017437	AG	3	6	841	846	50 %	0 %	50 %	0 %	385269642
23	NC_017437	GAA	2	6	880	885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385269642
24	NC_017437	AGA	2	6	909	914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385269642
25	NC_017437	AGA	2	6	963	968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385269642
26	NC_017437	CAA	2	6	1036	1041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385269642
27	NC_017437	AATG	2	8	1060	1067	50 %	25 %	25 %	0 %	385269642
28	NC_017437	TTG	2	6	1179	1184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385269642
29	NC_017437	CTC	2	6	1208	1213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385269642
30	NC_017437	GAT	2	6	1270	1275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385269642
31	NC_017437	GAT	2	6	1324	1329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385269642
32	NC_017437	GAAGGA	2	12	1354	1365	50 %	0 %	50 %	0 %	385269642
33	NC_017437	ATG	2	6	1387	1392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385269642
34	NC_017437	CTAT	2	8	1394	1401	25 %	50 %	0 %	25 %	385269642
35	NC_017437	CCT	2	6	1546	1551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385269642
36	NC_017437	CTT	2	6	1607	1612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385269642
37	NC_017437	CAG	2	6	1672	1677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385269642
38	NC_017437	TGA	2	6	1733	1738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385269642
39	NC_017437	A	6	6	1797	1802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017437	AAG	2	6	1814	1819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017437	TGG	2	6	1830	1835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017437	CTT	2	6	1837	1842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017437	T	7	7	1841	1847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017437	A	6	6	1852	1857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017437	AAGG	2	8	1903	1910	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017437	ATG	2	6	1930	1935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385269643
47	NC_017437	GTG	2	6	1936	1941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385269643
48	NC_017437	TCC	2	6	1945	1950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385269643
49	NC_017437	AGC	2	6	1959	1964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385269643
50	NC_017437	T	6	6	1978	1983	0 %	100 %	0 %	0 %	385269643
51	NC_017437	AGC	2	6	1986	1991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385269643
52	NC_017437	AAG	2	6	1997	2002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385269643
53	NC_017437	TAC	2	6	2035	2040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385269643
54	NC_017437	GCT	2	6	2045	2050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385269643
55	NC_017437	AGTA	2	8	2083	2090	50 %	25 %	25 %	0 %	385269643
56	NC_017437	AAC	2	6	2143	2148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385269643
57	NC_017437	AGA	2	6	2155	2160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385269643
58	NC_017437	T	6	6	2233	2238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017437	TAA	2	6	2245	2250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017437	T	7	7	2255	2261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017437	TC	3	6	2264	2269	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017437	A	6	6	2327	2332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017437	AGA	2	6	2411	2416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385269644
64	NC_017437	ATC	2	6	2418	2423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385269644
65	NC_017437	TGC	2	6	2438	2443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385269644
66	NC_017437	ATGA	2	8	2487	2494	50 %	25 %	25 %	0 %	385269644
67	NC_017437	GATA	2	8	2525	2532	50 %	25 %	25 %	0 %	385269644
68	NC_017437	CAT	2	6	2562	2567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385269644
69	NC_017437	AGA	2	6	2591	2596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385269644
70	NC_017437	AAG	2	6	2620	2625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385269644
71	NC_017437	GGA	2	6	2655	2660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385269644
72	NC_017437	AG	3	6	2747	2752	50 %	0 %	50 %	0 %	385269645
73	NC_017437	ATC	2	6	2784	2789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385269645
74	NC_017437	TTTC	2	8	2822	2829	0 %	75 %	0 %	25 %	385269645
75	NC_017437	ATA	2	6	2934	2939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385269645
76	NC_017437	AAC	2	6	2959	2964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385269645
77	NC_017437	GGT	2	6	3013	3018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385269645
78	NC_017437	AAT	2	6	3119	3124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385269645
79	NC_017437	TTC	2	6	3154	3159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385269645
80	NC_017437	GCA	2	6	3173	3178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385269645
81	NC_017437	GGA	2	6	3221	3226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385269645
82	NC_017437	CAG	2	6	3240	3245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385269645
83	NC_017437	GTT	2	6	3257	3262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385269645
84	NC_017437	GGT	2	6	3349	3354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385269645
85	NC_017437	GA	3	6	3415	3420	50 %	0 %	50 %	0 %	385269645
86	NC_017437	T	6	6	3422	3427	0 %	100 %	0 %	0 %	385269645
87	NC_017437	AAG	2	6	3507	3512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385269645
88	NC_017437	ATT	2	6	3569	3574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385269645
89	NC_017437	TTG	2	6	3621	3626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385269645
90	NC_017437	CATG	2	8	3703	3710	25 %	25 %	25 %	25 %	385269645
91	NC_017437	AAG	2	6	3732	3737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385269645
92	NC_017437	AAG	2	6	3747	3752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385269645
93	NC_017437	CAG	2	6	3789	3794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385269645
94	NC_017437	GCT	2	6	3860	3865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385269645
95	NC_017437	TGTGA	2	10	3875	3884	20 %	40 %	40 %	0 %	385269645
96	NC_017437	TTCC	2	8	4008	4015	0 %	50 %	0 %	50 %	385269645
97	NC_017437	AAG	2	6	4026	4031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385269645
98	NC_017437	CAG	2	6	4076	4081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385269645
99	NC_017437	GGA	2	6	4163	4168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385269645
100	NC_017437	AAT	2	6	4173	4178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385269645
101	NC_017437	TTGAA	2	10	4231	4240	40 %	40 %	20 %	0 %	385269646
102	NC_017437	ATT	2	6	4253	4258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385269646
103	NC_017437	TGA	2	6	4283	4288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385269646
104	NC_017437	TTTA	2	8	4406	4413	25 %	75 %	0 %	0 %	385269646
105	NC_017437	GTA	2	6	4515	4520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385269646
106	NC_017437	GAGAA	2	10	4525	4534	60 %	0 %	40 %	0 %	385269646
107	NC_017437	AGA	2	6	4562	4567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385269646
108	NC_017437	ATCC	2	8	4706	4713	25 %	25 %	0 %	50 %	385269646
109	NC_017437	GAA	2	6	4746	4751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385269646
110	NC_017437	CGT	2	6	4878	4883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385269646
111	NC_017437	A	7	7	4922	4928	100 %	0 %	0 %	0 %	385269646
112	NC_017437	GTT	2	6	4929	4934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385269646
113	NC_017437	GAAAA	2	10	4962	4971	80 %	0 %	20 %	0 %	385269646
114	NC_017437	A	7	7	4968	4974	100 %	0 %	0 %	0 %	385269646
115	NC_017437	TGA	2	6	5066	5071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385269646
116	NC_017437	TTACA	2	10	5117	5126	40 %	40 %	0 %	20 %	385269646
117	NC_017437	TTG	2	6	5161	5166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385269646
118	NC_017437	TTC	2	6	5302	5307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385269646
119	NC_017437	TCT	2	6	5394	5399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385269646
120	NC_017437	AGA	2	6	5414	5419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385269646
121	NC_017437	GTT	2	6	5441	5446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385269646
122	NC_017437	GACG	2	8	5453	5460	25 %	0 %	50 %	25 %	385269646
123	NC_017437	GGT	2	6	5489	5494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385269646
124	NC_017437	AAAGCT	2	12	5535	5546	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385269646
125	NC_017437	TTGG	2	8	5556	5563	0 %	50 %	50 %	0 %	385269646
126	NC_017437	CTC	2	6	5593	5598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385269646
127	NC_017437	AGC	2	6	5624	5629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385269646
128	NC_017437	GCA	2	6	5649	5654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017437	A	6	6	5660	5665	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017437	AGA	2	6	5676	5681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017437	ATT	2	6	5743	5748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385269647
132	NC_017437	TCT	2	6	5761	5766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385269647
133	NC_017437	GCT	2	6	5807	5812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385269647
134	NC_017437	GTCTT	2	10	5813	5822	0 %	60 %	20 %	20 %	385269647
135	NC_017437	GAT	2	6	5842	5847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385269647
136	NC_017437	TC	3	6	5858	5863	0 %	50 %	0 %	50 %	385269647
137	NC_017437	GA	3	6	5869	5874	50 %	0 %	50 %	0 %	385269647
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399	NC_017437	GA	3	6	18121	18126	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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